Группа (био)молекулярной инженерии
Группа (био)молекулярной инженерии
Состав группы
Группа входит в состав кафедры медицинской химии, лаборатории биогибридных технологий.
Руководитель группы: Рязанцев Михаил Николаевич, д.х.н., доцент
Николаев Дмитрий Михайлович, н.с.
Штыров Андрей Андреевич, м.н.с.
Домский Никита Анатольевич, м.н.с.
Метелкина Екатерина Михайловна, лаборант-исследователь
Панов Максим Сергеевич, к.х.н., с.н.с.
Демидов Никита Александрович, студент 1 года магистратуры
Квашнин Ярослав Дмитриевич, студент 1 года магистратуры
Направления исследований
Основным направлением исследований группы является направленный дизайн молекулярных и биомолекулярных систем, оптимизация их свойств и синтез. Мы заинтересованы как в получении различных объектов путем применения систематических методов молекулярного дизайна, так и в разработке новых методов и подходов для направленного дизайна и оптимизации свойств молекулярных и биомолекулярных систем. Исследования группы являются междисциплинарными, включают как применение экспериментальных методов, так и методов компьютерного моделирования.
Текущие направления исследований.
1. Дизайн и синтез белков, в том числе фотоактивируемых белков, для биомедицинских исследований.
2. Дизайн низкомолекулярных биологически активных лигандов, включая фотофармакологические лиганды, для применений в медицине и фармакологии. 3. Разработка общих методов и программного обеспечения для computer-aided дизайна (био)молекулярных систем и химических реакций, таких как методы направленной эволюции in silico, методы получения молекулярно-механических силовых полей для кофакторов на основе алгоритмов машинного обучения, методы для автоматизированного систематического поиска путей химических реакций.
Подробную информацию о текущих проектах можно найти на сайте группы: https://msdegroup.com
Преподавание
Разработаны и читаются курсы:
- Методы компьютерного моделирования биохимических систем;
- Основы биофизики;
- Основы нанобиотехнологий и молекулярной биоинженерии
Разработан онлайн-курс по компьютерному моделированию химических реакций. Курс можно найти на платформе "Открытое образование": https://openedu.ru/course/spbu/CHEMISTRY_MODELING/
Версия курса на английском языке:
Гранты
2023-2026 грант РНФ № 23-73-00041 «Комбинированное применение методов направленной эволюции и рационального дизайна для получения белков с заданными свойствами: молекулярный дизайн флуоресцентных родопсинов» (руководитель — Рязанцев М.Н.)
Публикации
Более 20 публикаций за последние 3 года, включая как публикации сделанные нашей группой, так и в сотрудничестве с другими научными группами. Актуальный список публикаций можно найти на сайте: https://msdegroup.com/publications