Лаборатория синтеза биологически активных малых молекул

Научная группа профессора Дмитрия Викторовича Дарьина
Уникальное сочетание специалистов в области тонкого органического синтеза и дизайна лекарственных препаратов позволяет нашей научной группе опираться на принцип «от метода к медицинскому приложению». Синтетические инновации открывают доступ к редким и захватывающим областям химического пространства, а опыт в создании терапевтических агентов позволяет немедленно найти применение получаемым молекулам. Разработка синтетических методов ведется по трем основным направлениям – химия диазосоединений (профессор, д.х.н., руководитель лаборатории Д.В. Дарьин), многокомпонентные реакции (к.х.н., доцент Бакулина О.Ю.) и химия гетероциклов среднего размера (к.х.н., доцент А.В. Сапегин). Дидактический компонент при работе со студентами и аспирантами основан на реализации высокоуровневых синтетических проектов параллельно с освоением сложного и увлекательного мира медицинской химии.
Руководитель научной группы
Дарьин Дмитрий Викторович
d.dariin@spbu.ru
Доцент
Бакулина Ольга Юрьевна
o.bakulina@spbu.ru
Доцент
Сапегин Александр Владимирович
a.sapegin@spbu.ru
Научный сотрудник
Кантин Григорий Павлович
grigory.kantin@spbu.ru
Научный сотрудник
Гуранова Наталья Игоревна
n.guranova@spbu.ru
Аспирант 4-го года обучения
Ананьева Анна Алексеевна
Аспирант 4-го года обучения
Левашова Екатерина Юрьевна
Ассистент
Парамонова Полина Сергеевна
Аспирант 1-го года обучения
Радюпов Валентин Эдуардович
Студент 2 курса магистратуры
Баранов Михаил Максимович
Студент 2 курса магистратуры
Карпов Вячеслав Олегович
Студент 2 курса магистратуры
Кузнецов Роман Алексеевич
Студент 2 курса магистратуры
Черкезов Осман Джаферович
Студент 2 курса магистратуры
Шевалев Роберт Максимович
Студент 1 курса магистратуры
Ходосова Ирина Дмитриевна
Студент 1 курса магистратуры
Кужман Мария Михайловна
Лаборант-исследователь
Татаринов Илья Александрович
Студент 4 курса бакалавриата
Лютин Иван Константинович
Студент 4 курса бакалавриата
Коноплев Михаил Витальевич
Студент 3 курса бакалавриата
Адамчик Мария Александровна
Студент 3 курса бакалавриата
Решетникова Анастасия Дмитриевна
Студент 3 курса бакалавриата
Лытонин Иван Дмитриевич
  • Тонкий органический синтез: многокомпонентные реакции с участием иминов; синтез полифункционализированных лактамов с различным размером цикла; превращения диазосоединений; разработка новых подходов к синтезу и модификации циклов среднего размера и различных гетероциклов
  • Медицинская химия: разработка протеолиз-таргетированных химер (РROTAC) для направленной деградации цитозольных белков; поиск новых молекул с противотуберкулезной активностью; разработка лигандов рецепторов следовых аминов (TAAR); синтез и исследование изоформно-селективных ингибиторов карбоангидразы человека (hCA), ингибиторов бактериальных металло-бета-лактамаз (MBL) и тиоредоксинредуктазы (TrxR)
Наиболее значимые публикации
Levashova E., Bischof L., Bunev A., Sapegin A., Grygor'eva O., Kudinov A., Ebeling S., Tatarinov I., Dar'in D., Kantin G., Hartmann M.D., Kalinin S. Extending the chemical space of glutarimide-based cereblon ligands through an efficient Rh(II)-catalyzed X-H insertion reaction // European Journal of Medicinal Chemistry. 2025. Vol. 301. 118235. DOI: 10.1016/j.ejmech.2025.118235.

Krivovicheva V., Lyutin I., Kantin G., Dar'in D. Access to Spiro Bis-β-lactams via a Metal-Free Microwave-Assisted Wolff Rearrangement/Staudinger [2+2] Cycloaddition Cascade Involving 3-Diazotetramic Acids and Imines // The Journal of Organic Chemistry. 2024. Vol. 89. № 5. p. 3585 – 3589. DOI: 10.1021/acs.joc.3c02494

Krivovicheva V., Bubyrev A., Kalinin S., Dar'in D., Gureev M., Burianova V., Vullo D., Krasavin M., Supuran C.T. Versatile Diazomethane Sulfonamide for Expedited Exploration of Azole-Based Carbonic Anhydrase Inhibitors via [3+2] Cycloaddition // ChemMedChem. 2023. Vol. 18. № 6. e202200607. DOI: 10.1002/cmdc.202200607

Krasavin M., Bubyrev A., Kazantsev A., Heim C., Maiwald S., Zhukovsky D., Dar'in D., Hartmann M.D., Bunev A. Replacing the phthalimide core in thalidomide with benzotriazole // Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry. 2022. Vol. 37. № 1. p. 527 – 530. DOI: 10.1080/14756366.2021.2024525

Hiesinger K., Dar’in D., Proschak E., Krasavin M. Spirocyclic Scaffolds in Medicinal Chemistry // The Journal of Medicinal Chemistry. 2021. Vol. 64. p. 150 – 183.
DOI: 10.1021/acs.jmedchem.0c01473

Патенты
  • Лукин А.Ю., Виноградова Т.И., Догонадзе М.З., Виноградова Л.В., Комарова К.Ю., Дарьин Д.В., Заболотных Н.В., Лаврова А.И., Постников Е.Б., Глухов Д.А., Сычев А.В., Яблонский П.К. 1-[(5-Нитрофуран-2-ил)-2’-фенил-1H, 7’H-спиро[азетидин-3,5’-фуро[3,4-d]пиримидин], обладающий противотуберкулёзной активностью в отношении возбудителя туберкулёза с множественной лекарственной устойчивостью, и способ его получения. Патент № RU 2824815. Дата приоритета 20.11.2023
  • Лукин А.Ю., Виноградова Т.И., Догонадзе М.З., Виноградова Л.В., Комарова К.Ю., Дарьин Д.В., Заболотных Н.В., Лаврова А.И., Постников Е.Б., Глухов Д.А., Сычев А.В., Яблонский П.К. 1-[(5-Нитрофуран-2-ил)-2’-пропил-1H, 7’H-спиро[азетидин-3,5’-фуро[3,4-d]пиримидин], обладающий противотуберкулёзной активностью в отношении возбудителя туберкулёза с множественной лекарственной устойчивостью, и способ его получения. Патент № RU 2824817. Дата приоритета 20.11.2023
  • Лукин А.Ю., Виноградова Т.И., Догонадзе М.З., Виноградова Л.В., Комарова К.Ю., Дарьин Д.В., Лаврова А.И., Постников Е.Б., Сычев А.В., Яблонский П.К. 1-[(5-нитрофуран-2-ил)карбонил]-2’-циклогексил-1H, 7’H-спиро[азетидин-3,5’-фуро[3,4-d]пиримидин], обладающий противотуберкулёзной активностью в отношении возбудителя туберкулёза с множественной лекарственной устойчивостью, и способ его получения. Патент № RU 2825647. Дата приоритета 11.09.2023
  • Лукин А.Ю., Виноградова Т.И., Догонадзе М.З., Комарова К.Ю., Виноградова Л.В., Дарьин Д.В., Лаврова А.И., Постников Е.Б., Сычев А.В., Яблонский П.К. 8-(4-Метил-4Н-1,2,4-триазол-3-ил)-6-(метилсульфонил)-2-(5-нитро-2-фуроил)-2,6-диазаспиро[3.4]октан, обладающий противотуберкулёзной активностью в отношении возбудителя туберкулёза с множественной лекарственной устойчивостью, и способ его получения. Патент № RU 2825646. Дата приоритета 04.09.2023
  • Yeremenko N., Brouard S., Tomilin A., Krasavin M., Gureev M. Small-molecule inhibitors targeting the BOB1/OCT1 interface. Патент № WO/2023/180387. Дата приоритета 03.10.2022
  • Красавин М.Ю., Дарьин Д.В., Кантин Г.П. Способ получения α-диазокарбонильных соединений в водной среде. Патент № RU 2686489. Дата приоритета 27.12.2018
  • Красавин М.Ю., Трифонов Р.Е., Толстяков В.В., Дарьин Д.В., Виноградова Т.И., Маничева О.А., Догонадзе М.З., Заболотных Н.В., Витовская М.Л., Яблонский П.К. 5-метил-7-(3-нитро-[1,2,4]триазол-1-ил)-[1,2,4]триазоло[1,5-a]пиримидина, обладающий противотуберкулёзной активностью в отношении возбудителя с множественной лекарственной устойчивостью, и способ его получения. Патент № RU 2705591. Дата приоритета 10.08.2018
Научные проекты
  • НИР «Дизайн и синтез химических соединений, обладающих противовирусной активностью», договор № 01/1-55-39 (руководитель Дарьин Д.В.)
  • Грант РНФ № 22-13-00005 «Расширение химического инструментария для целенаправленной деградации белков» 2022-2025 (руководитель Кантин Г.П.)
  • Грант РНФ № 19-75-30008 «Разработка инновационных лекарственных средств на основе TAAR рецепторов следовых аминов» 2019-2025 (Гайнетдинов Р.Р.)
  • Грант РФФИ 21-53-12001 «Спироциклические скаффолды в качестве миметиков жирных кислот для улучшения растворимости, биодоступности и селективности» 2021-2024 (Дарьин Д.В.)
  • Грант РНФ № 20-13-00024 «Диазогетероциклы: новая платформа для скаффолд-ориентированного синтеза» 2020-2024 (Дарьин Д.В.)
  • Грант РФФИ 20-53-56002 «Использование возможностей постконденсационных модификаций продуктов реакции GBB (Гребке-Блакберна-Бьенеме) в конструировании новых молекулярных скаффолдов для дизайна биологически активных веществ» 2020-2023 (Сапегин А.В.)
  • Грант РНФ № 20-73-10078 «Не ангидридом единым: принципиальное расширение круга субстратов реакции Кастаньоли-Кушмана» 2020-2022 (Бакулина О.Ю.)
  • Грант РФФИ № 18-515-76001 «Разработка ингибиторов тиоредоксинредуктазы в качестве новых противораковых агентов» 2018-2019 (Красавин М.Ю.)
  • Грант РФФИ № 19-03-00775 «Синтез и превращения альфа-диазолактамов как эффективный подход для получения нового разнообразия азотистых гетероциклов» 2019-2021 (Дарьин Д.В.)
  • Грант №18-33-20194 «Новые скаффолд-ориентированные подходы к созданию химического разнообразия для биоскрининга на основе многокомпонентной химии и химии диазосоединений» 2018-2020 (Бакулина О.Ю.)
  • Грант РНФ № 18-73-00074 «Создание многомерного химического пространства флуоресцентных катионселективных хемосенсоров на основе единой стратегии синтеза - мультикомпонентной реакции Кастаньоли-Кушмана» 2018-2020 (Бакулина О.Ю.)